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如何自动化进行特征工程

生信阿拉丁 生信阿拉丁 2022-05-16

如何自动化进行特征工程


工业界流传者这么一句话:数据和特征决定了机器学习的上限,而模型和算法只是逼近这个上限而已。


特征工程就是将原始的数据处理成合格的数据输入的一个过程,但是这个过程是很耗时、很繁琐、很无聊,但是又很重要的一个过程。


使用Featuretools这个工具,可以很自动化地进行特征工程的操作。它擅长将时间和关系的数据集转换成机器学习的特征矩阵。


下面我们来看看吧。


安 装



使用pip轻松安装Featuretools。

pip install featuretools 

可以使用清华的源来加速安装


pip install featuretools -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

使 用



官方推荐有两种形式,一种是分步定义,一种是entityset定义

分步定义

首先看代码

import featuretools as ft
data = ft.demo.load_mock_customer()
customers_df = data["customers"]
sessions_df = data["sessions"]
transactions_df = data["transactions"]

导入示例数据,并且存成三个dataframe,然后定义entities

entities = {
       "customers" : (customers_df, "customer_id"),
       "sessions" : (sessions_df, "session_id""session_start"),
       "transactions" : (transactions_df, "transaction_id""transaction_time")
    }

定义数据矩阵之间的关系

relationships = [("sessions""session_id""transactions""session_id"),
                     ("customers""customer_id""sessions""customer_id")]

运行Deep Feature ,进行特征生成,针对customer这个表格进行特征生成

feature_matrix_customers, features_defs = ft.dfs(entities=entities,
                                                     relationships=relationships,
                                                     target_entity="customers"

通过修改target_entity这个参数来调整生成的表格。


使用entityset定义

也可以使用entityset,首先看代码

import featuretools as ft
data = ft.demo.load_mock_customer()
transactions_df = data["transactions"].merge(data["sessions"]).merge(data["customers"])
products_df = data["products"]

生成一个entityset

es = ft.EntitySet(id="customer_data")

添加一个实体

es = es.entity_from_dataframe(entity_id="transactions",
                              dataframe=transactions_df,
                              index="transaction_id",
                              time_index="transaction_time",
                             variable_types={"product_id": ft.variable_types.Categorical,
                                               "zip_code": ft.variable_types.ZIPCode})

添加另一个实体

es = es.entity_from_dataframe(entity_id="products",
                                  dataframe=products_df,
                                  index="product_id")

添加关系

new_relationship = ft.Relationship(es["products"]["product_id"],
                                   es["transactions"]["product_id"])

生成新的特征

feature_matrix, feature_defs = ft.dfs(entityset=es,
                                      target_entity="products")

此外,可以用normalize_entity()来对原始表格产生一个新的entity。具体的见官方说明就可以啦。

结 语


特征工程包含的内容有很多,今天只是介绍了一个方面:特征的自动化生成,请大家后续继续关注我们的其他推文。

参考文献



  • https://www.cnblogs.com/weibao/p/6252280.html

  • https://featuretools.alteryx.com/en/stable/



作者:童蒙

编辑:angelica



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